Der Vorstand der Fraunhofer-Gesellschaft besteht aus dem Präsidenten und weiteren hauptamtlichen Mitgliedern. Zu seinen Aufgaben zählen:

• Geschäftsführung und Vertretung der Fraunhofer-Gesellschaft nach innen und außen

• Erarbeitung der Grundzüge der Wissenschafts- und Forschungspolitik sowie Ausbau- und Finanzplanung

• Akquisition der Grundfinanzierung der Fraunhofer-Gesellschaft und Verteilung auf die Institute

• Berufung der Institutsleiter 

Das Präsidium beteiligt sich an der Entscheidungsfindung des Vorstands und hat ein Vorschlags-, Empfehlungs- und Anhörungsrecht. Das Präsidium tritt vierteljährlich zusammen. Das Präsidium besteht aus dem Vorstand und den im Folgenden aufgeführten Verbundvorsitzenden:

Prof. Dr.-Ing. Hubert Lakner
Fraunhofer-Institut für Photonische Mikrosysteme IPMS

Prof. Dr.-Ing. Peter Elsner
Fraunhofer-Institut für Chemische Technologie ICT

Prof. Dr. Thomas Hirth
Fraunhofer-Institut für Grenzflächen- und Bioverfahrenstechnik IGB

Prof. Dr. Matthias Jarke
Fraunhofer-Institut für Angewandte Informationstechnik FIT

Prof. Dr.-Ing. Dr.-Ing. E. h. Fritz Klocke
Fraunhofer-Institut für Produktionstechnologie IPT

Prof. Dr. Klaus Thoma (Gastmitglied)
Fraunhofer-Institut für Kurzzeitdynamik, Ernst-Mach-Institut EMI

Prof. Dr. Andreas Tünnermann
Fraunhofer-Institut für Angewandte Optik und Feinmechanik IOF

sowie als Gast der Vorsitzende des Wissenschaftlich-Technischen Rats WTR, Prof. Dr. Dieter Prätzel-Wolters.